A Kodolányi János Egyetem első számú felelős vezetője és képviselője a rektor.
A Kodolányi János Egyetem megbízott rektora:
2023. május 17-én a Kodolányi János Egyetemet fenntartó cégnek új tulajdonosa lett, mely a korábbi egyetemi vezetés eredményeinek elismerése és fenntartása mellett alapvető változásokat kíván életbe léptetni az egyetem életében, integrálva azt egy nagyobb holding, az Albensis Tudásközpont képzési portfóliójába. Így olyan szervezeti és stratégiai változásokat kíván végrehajtani, mely megújult egyetemi vezetést igényel. Ennek részeként az egyetem alapító rektora Dr. Szabó Péter az Egyetem fenntartójával közös megegyezés alapján 2023. augusztus 22-én lemondott rektori kinevezéséről annak érdekében, hogy az egyetem szenátusa által szabályosan kiírásra javasolt pályázat nyomán az új fenntartói elképzelések és az Egyetem számára is a legmegfelelőbb rektort lehessen mihamarabb választani.
Mits Gergely, a KJE Fenntartó Zrt. vezérigazgatója köszönetet mondott Rektor úrnak a több évtizedes egyetem alapítói, szervezői és irányítói feladatkörben végzett munkájáért, mely nélkül ma a magyar felsőoktatás és különösen Székesfehérvár sokkal szegényebb lenne. Az elmúlt évtizedekben kiadott több mint harmincezer diploma beszédes szám, ahogy a 30 éves egyetemi múlt is.
Tekintettel a kialakult helyzetre a 2011. évi CCIV. törvény a nemzeti felsőoktatásról 2. § (2) pontja alapján a fenntartói jogok gyakorlója Dr. Vizi László Tamás általános rektorhelyettest bízta meg a rektori feladok átmeneti ellátásával.