A Kodolányin folyó kutatásokat a Tudományos Rektorhelyettesi Iroda koordinálja, ennek feladata - többek között - a bachelor, ill. főiskolai szakok kutatási hátterének biztosítása. A kutatás adminisztrációs és infrastrukturális támogatása mellett részt vesz a főiskola fejlesztési folyamataiban is, pl. külső pályázatok révén a számítógépes infrastruktúra, a sokszorosítás, a tanszéki kutatás feltételeinek megteremtéséhez is hozzájárul. A KJF kutatási stratégiájának fontos eleme, hogy a szakok kutatási hátterét megteremtse: ennek eszköze az országosan elismert kutatóműhelyek létrehozása, amelyekhez ma már regionális és intézményi szintű műhelyek is kapcsolódnak.
Jelenleg a következő kutatóműhelyek, működnek a Kodolányi János Főiskolán: Innovációs Kutatócsoport, Minőségműhely, MTA RKK városfejlesztési kutatások, Szolgáltatástudományi Műhely; Történeti Műhely, Hungarológiai Műhely, Neveléstörténet Kutatócsoport, Interkulturális Kommunikáció Kutatócsoport, WEB-2.0 Kommunikációs Kutatócsoport, Iskolai Szociális Munka Műhely, Autizmus Tudásközpont, Zeneoktatási Műhely.
A főiskola különös figyelmet szentel a kiemelkedő képességű hallgatók tehetségének kibontakoztatására. Ösztönzi őket az általuk létrehozott munkák közönség előtti bemutatására és a versenyeken való részvételre. Emellett gondoskodik arról, hogy minden tanulmányi és kutatási projekttel kapcsolatos pályázat a hallgatók tudomására jusson. A tehetséggondozás kettős célt szolgál: a kiemelkedő tehetségű hallgatóknak lehetőséget nyújt képességeik kibontakoztatására, valamint felkészíti a továbbtanulni szándékozó hallgatókat a mesterszintű tanulmányokra.